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== Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) ==
<!--== Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) ==


* [[Media:190121_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Thermodynamik und Statistische Mechanik]], 21-23. Januar 2019
17-19. Januar 2022
* [[Media:carnot-1.2.zip|Simulationssoftware]], 21-23. Januar 2019
* Vorlesung ''Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik'' ([[Media:210118_HandoutTD.pdf‎|PDF]])
<!--
* Aufgaben ([[Media:210118_Aufgaben.pdf‎|PDF]])
* Lösungen Aufgaben 1-2 ([[Media:210118_LoesungenAufgaben12.pdf‎|PDF]])
* Lösungsblatt ([[Media:210118_Loesungsblatt.pdf‎|PDF]], [[Media:210118_Loesungsblatt.docx|Word]])
* Lösungsblatt Ergebnisse ([[Media:210120_LoesungsblattErgebnisse.pdf‎|PDF]])
* Simulationen Aufgabe 5 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe5.zip|ZIP]])
* Simulationen Aufgabe 6 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe6.zip|ZIP]])
* Simulationssoftware CARNOT für [[Media:carnot-2.1-win.zip|Windows]], [[Media:carnot-2.1-mac.zip|MacOS]], [[Media:carnot-2.1-linux.zip|Linux]]
 
18-20. Januar 2021
* Vorlesung ''Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik'' ([[Media:210118_HandoutTD.pdf‎|PDF]])
* Vorlesung ''Einführung in die Simulationssoftware Carnot'' ([[Media:210118_HandoutCarnot.pdf‎|PDF]])
* Aufgaben ([[Media:210118_Aufgaben.pdf‎|PDF]])
* Lösungen Aufgaben 1-2 ([[Media:210118_LoesungenAufgaben12.pdf‎|PDF]])
* Lösungsblatt ([[Media:210118_Loesungsblatt.pdf‎|PDF]], [[Media:210118_Loesungsblatt.docx|Word]])
* Lösungsblatt Ergebnisse ([[Media:210120_LoesungsblattErgebnisse.pdf‎|PDF]])
* Simulationen Aufgabe 5 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe5.zip|ZIP]])
* Simulationen Aufgabe 6 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe6.zip|ZIP]])
* Simulationssoftware CARNOT für [[Media:carnot-2.1-win.zip|Windows]], [[Media:carnot-2.1-mac.zip|MacOS]], [[Media:carnot-2.1-linux.zip|Linux]]
 
20-22. Januar 2020
* [[Media:200120_Aufgaben1-6b.pdf‎|Aufgaben]]
* [[Media:200120_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Vorlesung Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik]]
* [[Media:carnot-1.3.zip|Simulationssoftware]]
* [[Media:200120 LoesungenAufgaben1.pdf|Lösungen Aufgabe 1]]
* [[Media:200120 LoesungenAufgaben1-2.pdf|Lösungen Aufgaben 1-2]]
* [[Media:200122 ErgebnisseAufgabe5.pdf|Ergebnisse Aufgabe 5]]
* [[Media:200122 ErgebnisseAufgabe6.pdf|Ergebnisse Aufgabe 6]]
 
21-23. Januar 2019
* [[Media:190121_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Vorlesung Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik]]
* [[Media:190121_Aufgaben.pdf‎|Aufgaben]]
* [[Media:carnot-1.2.zip|Simulationssoftware]]
* [[Media:190123 Loesungen Aufgaben 2.3-3.2.pdf|Lösungen Aufgaben 2.3-3.2]]
* [[Media:180122_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Thermodynamik und Statistische Mechanik]], 22/24. Januar 2018
* [[Media:180122_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Thermodynamik und Statistische Mechanik]], 22/24. Januar 2018
* [[Simulation Setup]], 22/24. Januar 2018
* [[Simulation Setup]], 22/24. Januar 2018
-->
 
== Biophysikalische Chemie IV (BPC IV) ==
 
* [[Media:201207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 7. Dezember 2020
* [[Media:191118_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 18. November 2019
* [[Media:181126_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 26. November 2018
* [[Media:171127_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 27. November 2017
* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 5. Dezember 2016
* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 7. Dezember 2015
* [[Media:121203_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 3. Dezember 2012
* [[Media:091130_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 30. November 2009


== Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
== Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==


* [[Strukturrechnung mit CYANA]], 17-19. Dezember 2018
* [[Strukturrechnung mit CYANA]], 16-18. Dezember 2019
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (Dez 2018)]], 17-19. Dezember 2018
* [[Strukturrechnung mit CYANA (Dez 2017)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 18-20. Dezember 2017
* [[Strukturrechnung mit CYANA (Dez 2017)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 18-20. Dezember 2017
* [[Strukturrechnung mit CYANA (Jan 2016)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 20-21. Januar 2016
* [[Strukturrechnung mit CYANA (Jan 2016)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 20-21. Januar 2016
Line 22: Line 64:
* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 14. Januar 2010
* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 14. Januar 2010
* [[Strukturrechnung mit CYANA (2009)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 13. Januar 2009
* [[Strukturrechnung mit CYANA (2009)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 13. Januar 2009
-->


== Biophysikalische Chemie IV (BPC IV) ==
== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengang Biochemie) ==
 
==== Moleküldynamik-Simulation von Proteinen ====
 
* [[Media:190617 SkriptMD.pdf|Skript Vorlesung MD Simulation]], 17. Juni 2019
* [[Media:190617 SlidesMD.pdf|Slides Vorlesung MD Simulation]], 17. Juni 2019
* [[Media:190619 TutorialMD.pdf|Tutorial MD Simulation]], 17/19. Juni 2019
* [[Media:190619 TutorialMDAntwortenFragen.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial MD Simulation]], 19. Juni 2019
 
==== Strukturmodellierug von Proteinen ====
 
* [[Media:190624 SlidesModellig.pdf|Slides Vorlesung Strukturmodellierug]], 24. Juni 2019
* [[Media:190624 Tutorial Modelling.pdf|Tutorial Strukturmodellierung]], 24/26. Juni 2019
* [[Media:190626 AntwortenFragenTutorialModelling.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial Strukturmodellierung]], 26. Juni 2019


* [[Media:181126_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 26. November 2018
<!--* [[Media:171127_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 27. November 2017
* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 5. Dezember 2016
* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 7. Dezember 2015
* [[Media:121203_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 3. Dezember 2012
* [[Media:091130_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 30. November 2009
-->


== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengang Biochemie) ==
== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengang Biochemie) ==
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* [[Media:180625 Tutorial Modelling.pdf|Tutorial Strukturmodellierung]], 25/27. Juni 2018
* [[Media:180625 Tutorial Modelling.pdf|Tutorial Strukturmodellierung]], 25/27. Juni 2018
* [[Media:180627 AntwortenFragenTutorialModelling.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial Strukturmodellierung]], 27. Juni 2018
* [[Media:180627 AntwortenFragenTutorialModelling.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial Strukturmodellierung]], 27. Juni 2018
<!--Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben


* 15.04.2014 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
* 15.04.2014 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
Line 59: Line 106:


* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
-->
== Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) ==


* [[Media:180122_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Thermodynamik und Statistische Mechanik]], 22/24. Januar 2018
* [[Simulation Setup]], 22/24. Januar 2018


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== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengänge Bioinformatik und Biochemie) ==
== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengänge Bioinformatik und Biochemie) ==


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* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
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<!--
 
== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die statistische Physik ==
== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die statistische Physik ==


Beginn: 25.10.2012
Beginn: 25.10.2012
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<!--== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==


Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
Line 96: Line 137:
* 28.05. - 9.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
* 28.05. - 9.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
* 16.07.2013 Klausur
* 16.07.2013 Klausur
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<!--
* 26.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie/NMR (P. Güntert)
* 26.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie/NMR (P. Güntert)
* 03.05.2012 Proteinstrukturbestimmung mit NMR (P. Güntert)
* 03.05.2012 Proteinstrukturbestimmung mit NMR (P. Güntert)
Line 126: Line 166:
[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung&veranstaltung.veranstid=83818 Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]
[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung&veranstaltung.veranstid=83818 Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]
[http://www.cs.uni-frankfurt.de/index.php/de/studierende-studiengaenge/studierende-studiengaenge-master-bioinformatik.html Masterstudiengang Bioinformatik]
[http://www.cs.uni-frankfurt.de/index.php/de/studierende-studiengaenge/studierende-studiengaenge-master-bioinformatik.html Masterstudiengang Bioinformatik]
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== Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
== Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==


* [[Media:DockingSkript2013.pdf|Docking]] ([http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Download/bpc1docking2013.tgz Daten]), [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
* [[Media:DockingSkript2013.pdf|Docking]] ([http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Download/bpc1docking2013.tgz Daten]), [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
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* [[Media:100224_DockingAnleitung.pdf|Docking]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)
<!--* [[Media:100224_DockingAnleitung.pdf|Docking]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)
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<!--== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik ==
 
== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik ==


* 19.10.2012 [[Media:121019 Introduction.pdf‎|Einführung]]
* 19.10.2012 [[Media:121019 Introduction.pdf‎|Einführung]]
Line 149: Line 188:
* 08.02.2013 [[Media:130208 ProteinStructureSimilarity.pdf‎|Protein Structure Similarity]]
* 08.02.2013 [[Media:130208 ProteinStructureSimilarity.pdf‎|Protein Structure Similarity]]
* 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf‎|Structure Modeling]]
* 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf‎|Structure Modeling]]
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<!--== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
 
== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==


Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben
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* 12.04.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
* 12.04.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
* 19.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie ('''N260 3.13'''; P. Güntert)
* 19.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie ('''N260 3.13'''; P. Güntert)
Line 167: Line 206:
* 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
* 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
* 12.07.2012 Klausur
* 12.07.2012 Klausur
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<!--* Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
* Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
* Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
* Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
* '''Mo''' 11.06.2012 [http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Reprints/120611_Strukturbestimmung.pdf Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie und NMR] (P. Güntert; '''Blockkurs 9:00-17:00''')
* '''Mo''' 11.06.2012 [http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Reprints/120611_Strukturbestimmung.pdf Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie und NMR] (P. Güntert; '''Blockkurs 9:00-17:00''')
Line 214: Line 253:
* [[Media:090709_MembraneProteins.pdf‎|Membrane proteins]], 9. Juli 2009
* [[Media:090709_MembraneProteins.pdf‎|Membrane proteins]], 9. Juli 2009
* [[Media:090709_Uebungsaufgaben.pdf‎|Uebungsaufgaben]], 9. Juli 2009
* [[Media:090709_Uebungsaufgaben.pdf‎|Uebungsaufgaben]], 9. Juli 2009
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<!--Prüfungstermine zu dieser Vorlesung sind nur noch am 10.12.2009 möglich.  
Prüfungstermine zu dieser Vorlesung sind nur noch am 10.12.2009 möglich.  
Terminvereinbarung zur mündlichen Prüfung bitte im Sekretariat Biophysikalische Chemie, Biozentrum Raum N230 1.04, bei [mailto:s.fachinger@bpc.uni-frankfurt.de Frau Sigrid Oğuzer-Fachinger], Tel. 069 798 29630.
Terminvereinbarung zur mündlichen Prüfung bitte im Sekretariat Biophysikalische Chemie, Biozentrum Raum N230 1.04, bei [mailto:s.fachinger@bpc.uni-frankfurt.de Frau Sigrid Oğuzer-Fachinger], Tel. 069 798 29630.
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[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfoPerson&publishSubDir=personal&personal.pid=2667&menuid=&topitem=members&subitem=#treeview Eintrag im Hochschulinformationssystem HISQIS]
[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfoPerson&publishSubDir=personal&personal.pid=2667&menuid=&topitem=members&subitem=#treeview Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]

Latest revision as of 07:21, 3 June 2024


Eintrag im Vorlesungsverzeichnis

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