data_JY
# 
_chem_comp.id                                    JY 
_chem_comp.name                                  3-(2-{4-[2-(5-HYDROXY-2-METHYLENE-CYCLOHEXYLIDENE)-ETHYLIDENE]-7A-METHYL-OCTAHYDRO-INDEN-1-YL}-PROPYL)-PHENOL 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C28 H38 O2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         "22-(M-HYDROXYPHENYL)-23,24,25,26,27-PENTANOR VITAMIN D3" 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2001-06-06 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2008-10-14 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        406.600 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     JY 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        1J7E 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
JY O2   O2   O 0 1 N N N 36.710 122.661 -43.495 -1.534 2.043  -7.700 O2   JY 1  
JY C1   C1   C 0 1 N N N 40.089 121.336 -42.111 -2.467 -0.648 -5.249 C1   JY 2  
JY C2   C2   C 0 1 N N N 38.565 121.638 -42.177 -2.381 0.067  -6.601 C2   JY 3  
JY C3   C3   C 0 1 N N S 38.129 122.607 -43.348 -1.490 1.303  -6.478 C3   JY 4  
JY C4   C4   C 0 1 N N N 38.718 122.200 -44.734 -0.047 0.877  -6.192 C4   JY 5  
JY C5   C5   C 0 1 N N N 40.214 121.861 -44.648 -0.037 0.048  -4.923 C5   JY 6  
JY C6   C6   C 0 1 N N N 41.153 122.441 -45.579 0.864  0.265  -3.943 C6   JY 7  
JY C7   C7   C 0 1 N N N 42.641 122.457 -45.334 0.842  -0.556 -2.731 C7   JY 8  
JY C8   C8   C 0 1 N N N 43.607 122.384 -46.294 1.733  -0.341 -1.764 C8   JY 9  
JY C9   C9   C 0 1 N N N 43.307 122.203 -47.805 2.797  0.742  -1.861 C9   JY 10 
JY C10  C10  C 0 1 N N N 40.587 120.928 -43.498 -1.058 -1.013 -4.813 C10  JY 11 
JY C11  C11  C 0 1 N N N 44.003 123.268 -48.693 2.807  1.604  -0.600 C11  JY 12 
JY C12  C12  C 0 1 N N N 45.542 123.357 -48.414 2.823  0.746  0.676  C12  JY 13 
JY C13  C13  C 0 1 N N R 45.885 123.578 -46.884 1.600  -0.133 0.664  C13  JY 14 
JY C14  C14  C 0 1 N N S 45.123 122.500 -46.040 1.759  -1.151 -0.501 C14  JY 15 
JY C15  C15  C 0 1 N N N 45.676 122.778 -44.583 0.567  -2.079 -0.255 C15  JY 16 
JY C16  C16  C 0 1 N N N 47.155 123.245 -44.832 0.589  -2.264 1.288  C16  JY 17 
JY C17  C17  C 0 1 N N R 47.333 123.155 -46.380 1.320  -1.023 1.865  C17  JY 18 
JY C18  C18  C 0 1 N N N 45.419 125.060 -46.530 0.365  0.721  0.373  C18  JY 19 
JY C19  C19  C 0 1 N N N 41.262 119.772 -43.710 -0.763 -2.228 -4.349 C19  JY 20 
JY C20  C20  C 0 1 N N R 48.693 123.835 -46.915 0.423  -0.297 2.868  C20  JY 21 
JY C21  C21  C 0 1 N N N 48.664 125.386 -46.888 1.134  0.960  3.372  C21  JY 22 
JY C22  C22  C 0 1 N N N 49.119 123.387 -48.357 0.125  -1.222 4.050  C22  JY 23 
JY C23  C23  C 0 1 Y N N 49.843 119.582 -48.517 -2.948 0.063  5.827  C23  JY 24 
JY C24  C24  C 0 1 Y N N 51.252 119.550 -48.372 -2.389 0.806  6.850  C24  JY 25 
JY C25  C25  C 0 1 Y N N 51.985 120.775 -48.219 -1.009 0.893  6.968  C25  JY 26 
JY C26  C26  C 0 1 Y N N 51.276 122.006 -48.216 -0.194 0.230  6.061  C26  JY 27 
JY C27  C27  C 0 1 Y N N 49.865 122.053 -48.361 -0.758 -0.506 5.038  C27  JY 28 
JY C28  C28  C 0 1 Y N N 49.157 120.823 -48.512 -2.134 -0.591 4.922  C28  JY 29 
JY O1   O1   O 0 1 N N N 53.336 120.709 -48.082 -0.457 1.622  7.973  O1   JY 30 
JY HO21 1HO2 H 0 0 N N N 36.448 123.243 -44.198 -0.965 2.815  -7.579 HO21 JY 31 
JY H11  1H1  H 0 1 N N N 40.335 120.575 -41.334 -2.923 0.012  -4.513 H11  JY 32 
JY H12  2H1  H 0 1 N N N 40.670 122.189 -41.688 -3.065 -1.554 -5.351 H12  JY 33 
JY H21  1H2  H 0 1 N N N 38.207 122.032 -41.197 -3.380 0.370  -6.915 H21  JY 34 
JY H22  2H2  H 0 1 N N N 37.985 120.687 -42.227 -1.959 -0.610 -7.344 H22  JY 35 
JY H31  1H3  H 0 1 N N N 38.534 123.602 -43.049 -1.852 1.930  -5.662 H31  JY 36 
JY H41  1H4  H 0 1 N N N 38.525 122.985 -45.502 0.576  1.760  -6.058 H41  JY 37 
JY H42  2H4  H 0 1 N N N 38.139 121.363 -45.189 0.331  0.281  -7.022 H42  JY 38 
JY H61  1H6  H 0 1 N N N 40.725 122.881 -46.496 1.603  1.046  -4.053 H61  JY 39 
JY H71  1H7  H 0 1 N N N 43.078 122.532 -44.324 0.104  -1.337 -2.622 H71  JY 40 
JY H91  1H9  H 0 1 N N N 42.208 122.184 -47.993 3.774  0.276  -1.985 H91  JY 41 
JY H92  2H9  H 0 1 N N N 43.567 121.172 -48.142 2.589  1.373  -2.725 H92  JY 42 
JY H111 1H11 H 0 0 N N N 43.515 124.265 -48.585 3.692  2.240  -0.611 H111 JY 43 
JY H112 2H11 H 0 0 N N N 43.799 123.088 -49.774 1.918  2.235  -0.594 H112 JY 44 
JY H121 1H12 H 0 0 N N N 46.015 124.145 -49.045 3.716  0.123  0.692  H121 JY 45 
JY H122 2H12 H 0 0 N N N 46.071 122.461 -48.814 2.804  1.391  1.555  H122 JY 46 
JY H141 1H14 H 0 0 N N N 45.321 121.442 -46.331 2.698  -1.697 -0.414 H141 JY 47 
JY H151 1H15 H 0 0 N N N 45.576 121.918 -43.880 0.710  -3.034 -0.761 H151 JY 48 
JY H152 2H15 H 0 0 N N N 45.062 123.491 -43.985 -0.361 -1.607 -0.574 H152 JY 49 
JY H161 1H16 H 0 0 N N N 47.917 122.675 -44.251 1.132  -3.173 1.548  H161 JY 50 
JY H162 2H16 H 0 0 N N N 47.396 124.245 -44.402 -0.428 -2.311 1.673  H162 JY 51 
JY H171 1H17 H 0 0 N N N 47.573 122.166 -46.835 2.255  -1.322 2.341  H171 JY 52 
JY H181 1H18 H 0 0 N N N 44.350 125.259 -46.777 0.482  1.213  -0.591 H181 JY 53 
JY H182 2H18 H 0 0 N N N 45.661 125.216 -45.453 -0.519 0.085  0.352  H182 JY 54 
JY H183 3H18 H 0 0 N N N 45.861 125.835 -47.199 0.252  1.474  1.153  H183 JY 55 
JY H191 1H19 H 0 0 N N N 41.621 119.478 -44.710 0.246  -2.460 -4.046 H191 JY 56 
JY H192 2H19 H 0 0 N N N 41.531 119.098 -42.879 -1.535 -2.980 -4.276 H192 JY 57 
JY H201 1H20 H 0 0 N N N 49.449 123.461 -46.186 -0.511 -0.015 2.382  H201 JY 58 
JY H211 1H21 H 0 0 N N N 48.413 125.758 -45.867 2.069  0.679  3.857  H211 JY 59 
JY H212 2H21 H 0 0 N N N 49.605 125.856 -47.258 1.346  1.619  2.530  H212 JY 60 
JY H213 3H21 H 0 0 N N N 47.782 125.774 -47.450 0.495  1.478  4.086  H213 JY 61 
JY H221 1H22 H 0 0 N N N 49.716 124.181 -48.863 -0.381 -2.118 3.691  H221 JY 62 
JY H222 2H22 H 0 0 N N N 48.241 123.357 -49.043 1.059  -1.503 4.535  H222 JY 63 
JY H231 1H23 H 0 0 N N N 49.280 118.641 -48.634 -4.022 -0.004 5.735  H231 JY 64 
JY H241 1H24 H 0 0 N N N 51.774 118.579 -48.378 -3.025 1.318  7.556  H241 JY 65 
JY H261 1H26 H 0 0 N N N 51.835 122.949 -48.098 0.879  0.295  6.151  H261 JY 66 
JY H281 1H28 H 0 0 N N N 48.060 120.832 -48.627 -2.573 -1.171 4.124  H281 JY 67 
JY HO11 1HO1 H 0 0 N N N 53.821 121.520 -47.981 -0.342 1.023  8.723  HO11 JY 68 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
JY O2  C3   SING N N 1  
JY O2  HO21 SING N N 2  
JY C1  C2   SING N N 3  
JY C1  C10  SING N N 4  
JY C1  H11  SING N N 5  
JY C1  H12  SING N N 6  
JY C2  C3   SING N N 7  
JY C2  H21  SING N N 8  
JY C2  H22  SING N N 9  
JY C3  C4   SING N N 10 
JY C3  H31  SING N N 11 
JY C4  C5   SING N N 12 
JY C4  H41  SING N N 13 
JY C4  H42  SING N N 14 
JY C5  C6   DOUB N Z 15 
JY C5  C10  SING N N 16 
JY C6  C7   SING N N 17 
JY C6  H61  SING N N 18 
JY C7  C8   DOUB N E 19 
JY C7  H71  SING N N 20 
JY C8  C9   SING N N 21 
JY C8  C14  SING N N 22 
JY C9  C11  SING N N 23 
JY C9  H91  SING N N 24 
JY C9  H92  SING N N 25 
JY C10 C19  DOUB N N 26 
JY C11 C12  SING N N 27 
JY C11 H111 SING N N 28 
JY C11 H112 SING N N 29 
JY C12 C13  SING N N 30 
JY C12 H121 SING N N 31 
JY C12 H122 SING N N 32 
JY C13 C14  SING N N 33 
JY C13 C17  SING N N 34 
JY C13 C18  SING N N 35 
JY C14 C15  SING N N 36 
JY C14 H141 SING N N 37 
JY C15 C16  SING N N 38 
JY C15 H151 SING N N 39 
JY C15 H152 SING N N 40 
JY C16 C17  SING N N 41 
JY C16 H161 SING N N 42 
JY C16 H162 SING N N 43 
JY C17 C20  SING N N 44 
JY C17 H171 SING N N 45 
JY C18 H181 SING N N 46 
JY C18 H182 SING N N 47 
JY C18 H183 SING N N 48 
JY C19 H191 SING N N 49 
JY C19 H192 SING N N 50 
JY C20 C21  SING N N 51 
JY C20 C22  SING N N 52 
JY C20 H201 SING N N 53 
JY C21 H211 SING N N 54 
JY C21 H212 SING N N 55 
JY C21 H213 SING N N 56 
JY C22 C27  SING N N 57 
JY C22 H221 SING N N 58 
JY C22 H222 SING N N 59 
JY C23 C24  DOUB Y N 60 
JY C23 C28  SING Y N 61 
JY C23 H231 SING N N 62 
JY C24 C25  SING Y N 63 
JY C24 H241 SING N N 64 
JY C25 C26  DOUB Y N 65 
JY C25 O1   SING N N 66 
JY C26 C27  SING Y N 67 
JY C26 H261 SING N N 68 
JY C27 C28  DOUB Y N 69 
JY C28 H281 SING N N 70 
JY O1  HO11 SING N N 71 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
JY SMILES           ACDLabs              10.04 OC4CC(=C/C=C2\CCCC3(C)C(C(C)Cc1cccc(O)c1)CCC23)/C(=C)CC4 
JY InChI            InChI                1.02b 
InChI=1/C28H38O2/c1-19-9-12-25(30)18-23(19)11-10-22-7-5-15-28(3)26(13-14-27(22)28)20(2)16-21-6-4-8-24(29)17-21/h4,6,8,10-11,17,20,25-27,29-30H,1,5,7,9,12-16,18H2,2-3H3/b22-10+,23-11-/t20-,25+,26-,27+,28-/m1/s1 
JY InChIKey         InChI                1.02b FUULLJKQLABNSA-YPMWTJJSBT 
JY SMILES_CANONICAL CACTVS               3.341 C[C@H](Cc1cccc(O)c1)[C@H]2CC[C@H]3C(/CCC[C@]23C)=C/C=C4/C[C@@H](O)CCC4=C 
JY SMILES           CACTVS               3.341 C[CH](Cc1cccc(O)c1)[CH]2CC[CH]3C(CCC[C]23C)=CC=C4C[CH](O)CCC4=C 
JY SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 C[C@H](Cc1cccc(c1)O)[C@H]2CC[C@@H]\3[C@@]2(CCC/C3=C\C=C4C[C@H](CCC4=C)O)C 
JY SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 CC(Cc1cccc(c1)O)C2CCC3C2(CCCC3=CC=C4CC(CCC4=C)O)C 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
JY "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 "3-{(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-4-{(2Z)-2-[(5S)-5-hydroxy-2-methylidenecyclohexylidene]ethylidene}-7a-methyloctahydro-1H-inden-1-yl]propyl}phenol (non-preferred name)" 
JY "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 3-[(2R)-2-[(1R,3aS,4E,7aR)-4-[2-[(5S)-5-hydroxy-2-methylidene-cyclohexylidene]ethylidene]-7a-methyl-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-1-yl]propyl]phenol              
# 
