data_MSG
# 
_chem_comp.id                                    MSG 
_chem_comp.name                                  7-METHYL-6-THIO-GUANOSINE 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C11 H15 N5 O4 S" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2005-02-10 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2008-10-14 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        313.333 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     MSG 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        1YRY 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
MSG "O5'"  O5*  O 0  1 N N N 50.949 49.239 29.776 4.956  1.984  1.394  "O5'"  MSG 1  
MSG "C5'"  C5*  C 0  1 N N N 50.393 48.757 31.036 4.745  1.285  0.166  "C5'"  MSG 2  
MSG "C4'"  C4*  C 0  1 N N R 50.612 47.255 31.272 3.709  0.180  0.379  "C4'"  MSG 3  
MSG "O4'"  O4*  O 0  1 N N N 50.382 46.771 29.897 2.416  0.753  0.673  "O4'"  MSG 4  
MSG "C1'"  C1*  C 0  1 N N R 51.614 46.207 29.244 1.461  -0.286 0.369  "C1'"  MSG 5  
MSG N9     N9   N 0  1 Y N N 51.939 46.995 28.052 0.132  0.291  0.151  N9     MSG 6  
MSG C8     C8   C 0  1 Y N N 51.083 47.847 27.417 -0.141 1.581  -0.197 C8     MSG 7  
MSG N7     N7   N 1  1 Y N N 51.763 48.443 26.281 -1.427 1.750  -0.305 N7     MSG 8  
MSG C1     C1   C 0  1 N N N 51.071 48.113 25.034 -2.089 3.006  -0.663 C1     MSG 9  
MSG C5     C5   C 0  1 Y N N 53.043 47.882 26.310 -2.059 0.583  -0.029 C5     MSG 10 
MSG C6     C6   C 0  1 Y N N 54.125 48.171 25.360 -3.404 0.174  0.004  C6     MSG 11 
MSG S6     S6   S -1 1 N N N 54.069 49.301 23.954 -4.701 1.312  -0.355 S6     MSG 12 
MSG N1     N1   N 0  1 Y N N 55.280 47.425 25.699 -3.677 -1.089 0.318  N1     MSG 13 
MSG C2     C2   C 0  1 Y N N 55.386 46.535 26.774 -2.707 -1.953 0.590  C2     MSG 14 
MSG N2     N2   N 0  1 N N N 56.640 45.825 27.005 -3.044 -3.257 0.911  N2     MSG 15 
MSG N3     N3   N 0  1 Y N N 54.332 46.330 27.598 -1.429 -1.610 0.565  N3     MSG 16 
MSG C4     C4   C 0  1 Y N N 53.194 47.018 27.334 -1.067 -0.368 0.262  C4     MSG 17 
MSG "C2'"  C2*  C 0  1 N N R 52.719 46.191 30.295 1.983  -0.937 -0.931 "C2'"  MSG 18 
MSG "O2'"  O2*  O 0  1 N N N 53.168 44.804 30.438 1.767  -2.350 -0.913 "O2'"  MSG 19 
MSG "C3'"  C3*  C 0  1 N N S 52.083 46.789 31.633 3.497  -0.621 -0.925 "C3'"  MSG 20 
MSG "O3'"  O3*  O 0  1 N N N 52.112 45.750 32.699 4.262  -1.828 -0.900 "O3'"  MSG 21 
MSG "H5'"  H5*  H 0  1 N N N 50.814 50.168 29.630 5.615  2.669  1.216  "H5'"  MSG 22 
MSG "H5'1" 1H5* H 0  0 N N N 49.311 49.014 31.113 5.684  0.843  -0.167 "H5'1" MSG 23 
MSG "H5'2" 2H5* H 0  0 N N N 50.787 49.352 31.893 4.383  1.982  -0.591 "H5'2" MSG 24 
MSG "H4'"  H4*  H 0  1 N N N 49.986 46.901 32.124 4.022  -0.483 1.185  "H4'"  MSG 25 
MSG "H1'"  H1*  H 0  1 N N N 51.467 45.162 28.885 1.428  -1.020 1.174  "H1'"  MSG 26 
MSG H8     H8   H 0  1 N N N 50.047 48.020 27.755 0.600  2.350  -0.359 H8     MSG 27 
MSG H11    1H1  H 0  1 N N N 49.995 48.401 25.070 -2.203 3.061  -1.746 H11    MSG 28 
MSG H12    2H1  H 0  1 N N N 51.593 48.571 24.162 -3.070 3.048  -0.192 H12    MSG 29 
MSG H13    3H1  H 0  1 N N N 50.945 47.012 24.910 -1.485 3.846  -0.319 H13    MSG 30 
MSG HN21   1HN2 H 0  0 N N N 57.392 46.510 27.076 -2.348 -3.902 1.113  HN21   MSG 31 
MSG HN22   2HN2 H 0  0 N N N 56.717 45.176 27.788 -3.976 -3.526 0.934  HN22   MSG 32 
MSG "H2'"  H2*  H 0  1 N N N 53.610 46.805 30.026 1.503  -0.490 -1.801 "H2'"  MSG 33 
MSG H2     H2   H 0  1 N N N 53.856 44.794 31.093 2.167  -2.704 -1.718 H2     MSG 34 
MSG "H3'"  H3*  H 0  1 N N N 52.656 47.662 32.025 3.766  -0.018 -1.792 "H3'"  MSG 35 
MSG H1     H1   H 0  1 N N N 52.994 45.471 32.915 5.191  -1.569 -0.835 H1     MSG 36 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
MSG "O5'" "C5'"  SING N N 1  
MSG "O5'" "H5'"  SING N N 2  
MSG "C5'" "C4'"  SING N N 3  
MSG "C5'" "H5'1" SING N N 4  
MSG "C5'" "H5'2" SING N N 5  
MSG "C4'" "O4'"  SING N N 6  
MSG "C4'" "C3'"  SING N N 7  
MSG "C4'" "H4'"  SING N N 8  
MSG "O4'" "C1'"  SING N N 9  
MSG "C1'" N9     SING N N 10 
MSG "C1'" "C2'"  SING N N 11 
MSG "C1'" "H1'"  SING N N 12 
MSG N9    C8     SING Y N 13 
MSG N9    C4     SING Y N 14 
MSG C8    N7     DOUB Y N 15 
MSG C8    H8     SING N N 16 
MSG N7    C1     SING N N 17 
MSG N7    C5     SING Y N 18 
MSG C1    H11    SING N N 19 
MSG C1    H12    SING N N 20 
MSG C1    H13    SING N N 21 
MSG C5    C6     SING Y N 22 
MSG C5    C4     DOUB Y N 23 
MSG C6    S6     SING N N 24 
MSG C6    N1     DOUB Y N 25 
MSG N1    C2     SING Y N 26 
MSG C2    N2     SING N N 27 
MSG C2    N3     DOUB Y N 28 
MSG N2    HN21   SING N N 29 
MSG N2    HN22   SING N N 30 
MSG N3    C4     SING Y N 31 
MSG "C2'" "O2'"  SING N N 32 
MSG "C2'" "C3'"  SING N N 33 
MSG "C2'" "H2'"  SING N N 34 
MSG "O2'" H2     SING N N 35 
MSG "C3'" "O3'"  SING N N 36 
MSG "C3'" "H3'"  SING N N 37 
MSG "O3'" H1     SING N N 38 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
MSG SMILES           ACDLabs              10.04 [S-]c3nc(nc1c3[n+](cn1C2OC(C(O)C2O)CO)C)N                                                                                                                   
MSG InChI            InChI                1.02b InChI=1/C11H15N5O4S/c1-15-3-16(8-5(15)9(21)14-11(12)13-8)10-7(19)6(18)4(2-17)20-10/h3-4,6-7,10,17-19H,2H2,1H3,(H2-,12,13,14,21)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1/f/h12H2 
MSG InChIKey         InChI                1.02b RFHIWBUKNJIBSE-ZTKQDUEXDL                                                                                                                                   
MSG SMILES_CANONICAL CACTVS               3.341 C[n+]1cn([C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c3nc(N)nc([S-])c13                                                                                               
MSG SMILES           CACTVS               3.341 C[n+]1cn([CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH]2O)c3nc(N)nc([S-])c13                                                                                                     
MSG SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 C[n+]1cn(c2c1c(nc(n2)N)[S-])[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O)O                                                                                             
MSG SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 C[n+]1cn(c2c1c(nc(n2)N)[S-])C3C(C(C(O3)CO)O)O                                                                                                               
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
MSG "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 2-amino-7-methyl-9-beta-D-ribofuranosyl-9H-purin-7-ium-6-thiolate                                    
MSG "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-7-methyl-purin-7-ium-6-thiolate 
# 
